CRISPR/Cas13a Ensayo Distinguishes SARS-CoV-2 De Sarbecovirus Relacionados, Con Límites de Detección de 15 a 150 Femtomolar
Un estudio publicado el 14 de noviembre en Scientific Reports presenta un ensayo CRISPR/Cas13a de doble canal diseñado para distinguir SARS-CoV-2 de los sarbecovirus relacionados utilizando objetivos de ARN sintéticos. Los autores son Leski, Dean, Johnson, Green, Díaz, Stenger y colegas.
Los investigadores construyeron un panel que cubrió 12 sarbecovirus zoonóticos y clasificaron los resultados en tres clases: SARS-CoV-2, su vecino más cercano BANAL-236, y el resto cerca de vecinos. El diseño de guía RNA utilizó una optimización de aprendizaje automático de dos etapas, cribiendo primero con RuleFit y luego reentrenando en 382 puntos de datos in vitro, con el umbral de exclusión de desajustes elevado de 4 a 6.
En experimentos sobre objetivos de ARN sintéticos, el límite de detección analítica del ensayo oscilaba entre 15 y 150 femtomolar. Los autores afirman que el trabajo demuestra, sobre objetivos sintéticos, la capacidad de un ensayo Cas13a para discriminar entre virus estrechamente relacionados.
Fuente: GSM · EE. UU. (edición en inglés · edición original en chino)
Foto: 图：SARS-CoV-2 病毒颗粒从实验室培养的细胞表面释出的透射电子显微镜图像。来源：NIAID-RML，Wikimedia Commons，CC BY 2.0。 / Photo: Transmission electron microscope image of SARS-CoV-2 virus particles emerging from a lab-cultured cell. Source: NIAID-RML, Wikimedia Commons, CC BY 2.0.
