CRISPR/Cas13a L'essai distingue le SRAS-CoV-2 des sarbécovirus apparentés, avec des limites de détection de 15 à 150 Fémomolaires
Une étude publiée le 14 novembre dans Scientific Reports présente un test à double canal CRISPR/Cas13a conçu pour distinguer le SRAS-CoV-2 des sarbécovirus apparentés à l'aide de cibles d'ARN synthétiques. Les auteurs sont Leski, Dean, Johnson, Green, Díaz, Stenger et ses collègues.
Les chercheurs ont construit un panel couvrant 12 sarbécovirus zoonotiques et trié les résultats en trois classes : le SRAS-CoV-2, son voisin le plus proche BANAL-236, et les autres proches. Guide La conception de l'ARN a utilisé une optimisation de l'apprentissage par machine en deux étapes, criblant d'abord avec RuleFit puis recyclant sur 382 points de données in vitro, le seuil d'exclusion de l'inadéquation passant de 4 à 6.
Lors d'expériences sur des cibles d'ARN synthétique, la limite de détection analytique du test variait de 15 à 150 femtomolaires. Les auteurs affirment que le travail démontre, sur des cibles synthétiques, la capacité d'un test Cas13a à distinguer les virus étroitement apparentés.
Source : GSM · États-Unis (édition en anglais · édition originale en chinois)
Photo: 图：SARS-CoV-2 病毒颗粒从实验室培养的细胞表面释出的透射电子显微镜图像。来源：NIAID-RML，Wikimedia Commons，CC BY 2.0。 / Photo: Transmission electron microscope image of SARS-CoV-2 virus particles emerging from a lab-cultured cell. Source: NIAID-RML, Wikimedia Commons, CC BY 2.0.
