CRISPR/Cas13aの試金は関連サルベコウイルスからのSARS-CoV-2を、検出の限界と15から150のフェムモラー放します

科学レポートで11月14日発表された研究では、合成RNAターゲットを用いたサルベコウイルスからSARS-CoV-2を区別するように設計されたデュアルチャンネルCRISPR/Cas13aアッセイを紹介します。 著者はレスキ、ディーン、ジョンソン、グリーン、ディアス、ステンガー、同僚です。
研究者は、12のゾノスティックサルベコウイルスを覆い、三つのクラスに選別された結果パネルを組み立てました:SARS-CoV-2、最も近い隣接するBANAL-236、および近隣の残りの部分。 ガイドRNAの設計は、2段の機械学習の最適化を使用しており、まずRuleFitでスクリーニングし、382をvitroデータポイントで再訓練し、4から6に上げられた不一致のしきい値で、します。
合成RNAターゲットの実験では、15~150フェムモラーの分析限界までを分析します。 著者は、作品が、合成ターゲットで、密接に関連したウイルス間で差別化するためのCas13aアッセイの能力を実証していることを述べています。
写真: 图:SARS-CoV-2 病毒颗粒从实验室培养的细胞表面释出的透射电子显微镜图像。来源:NIAID-RML,Wikimedia Commons,CC BY 2.0。 / Photo: Transmission electron microscope image of SARS-CoV-2 virus particles emerging from a lab-cultured cell. Source: NIAID-RML, Wikimedia Commons, CC BY 2.0.

