CRISPR/Cas13a Ensaio Distingue SARS-CoV-2 de Sarbecovírus relacionados, com limites de detecção de 15 a 150 Femtomolar
Um estudo publicado em 14 de novembro em Scientific Reports apresenta um ensaio de duplo canal CRISPR/Cas13a projetado para distinguir SARS-CoV-2 de sarbecovírus relacionados usando alvos de RNA sintéticos. Os autores são Leski, Dean, Johnson, Green, Díaz, Stenger, e colegas.
Os pesquisadores construíram um painel cobrindo 12 sarbecovírus zoonóticos e classificaram os resultados em três classes: SARS-CoV-2, seu vizinho mais próximo BANAL-236 e os vizinhos mais próximos. O projeto do RNA guia usou uma otimização de aprendizado de máquina em dois estágios, triagem primeiro com RuleFit e, em seguida, retreinamento em 382 pontos de dados in vitro, com o limiar de exclusão de incompatibilidade elevado de 4 para 6.
Em experimentos com alvos de RNA sintético, o limite de detecção analítica do ensaio variou de 15 a 150 femtomolar. Os autores afirmam que o trabalho demonstra, em alvos sintéticos, a capacidade de um ensaio Cas13a discriminar entre vírus intimamente relacionados.
Fonte: GSM · Estados Unidos (Edição em inglês · Edição original em chinês)
Foto: 图：SARS-CoV-2 病毒颗粒从实验室培养的细胞表面释出的透射电子显微镜图像。来源：NIAID-RML，Wikimedia Commons，CC BY 2.0。 / Photo: Transmission electron microscope image of SARS-CoV-2 virus particles emerging from a lab-cultured cell. Source: NIAID-RML, Wikimedia Commons, CC BY 2.0.
