CRISPR/Cas13a Assay Divides SARS-CoV-2 Mula sa Nauugnayng Sarbecoviruses, May Dimensiyong mga Hangganan ng 15 hanggang 150 Femtomolar
Ang isang pag-aaral na inilathala noong Nobyembre 14 sa Scientific Reports ay naghaharap ng dual-channel CRISPR/Cas13a assay na dinisenyo upang makilala ang SARS-CoV-2 mula sa mga kaugnay na sarbecovirus na gumagamit ng sintetikong mga target ng RNA. Ang mga awtor ay sina Leski, Dean, Johnson, Green, Díaz, Stenger, at mga kasamahan.
Ang mga mananaliksik ay nagtayo ng isang panel na sumasaklaw sa 12 zoonotiko sarbecovirus at nagbukud-tangi ng mga resulta sa tatlong klase: SARS-CoV-2, ang pinakamalapit nitong kapitbahay na BANAL-236, at ang natitirang malapit na mga kapitbahay. Ang disenyong RNA ay gumamit ng isang dalawang-stage machine na pag-aaral ng optimisasyon, pagsusuri muna sa pamamagitan ng RuleFit at pagkatapos ay muling pagsanay sa 382 in vitro data points, na ang mismatch official circulation stand na itinaas mula 4 hanggang 6.
Sa mga eksperimento sa sintetikong mga target ng RNA, ang analisis na limitasyon sa pagtutop ng assay ay mula 15 hanggang 150 femtomolar. Sinasabi ng mga awtor na ipinakikita ng akda, sa sintetikong mga target, ang kakayahan ng isang Cass13a assay na makilala ang mga virus na may malapit na kaugnayan.
Source: GSM · United States (Edisyong Ingles · Orihinal na edisyong Tsino)
Larawan: 图：SARS-CoV-2 病毒颗粒从实验室培养的细胞表面释出的透射电子显微镜图像。来源：NIAID-RML，Wikimedia Commons，CC BY 2.0。 / Photo: Transmission electron microscope image of SARS-CoV-2 virus particles emerging from a lab-cultured cell. Source: NIAID-RML, Wikimedia Commons, CC BY 2.0.
