CRISPR/Cas13a Assay Distinguishes SARS-CoV-2 З суміжних сарбековірусів, з видаленням лімітів 15 до 150 Femtomolar
14 листопада в наукових доповідях представлено двоканальний CRISPR/Cas13a assay, призначений для розрізнення SARS-CoV-2 з суміжних Sarbecoviruss з використанням синтетичних цілей РНК. Автори: Лескі, Деан, Джонсон, Грін, Діаз, Стенгер і колеги.
Дослідники побудували панельне покриття 12 зооотичних сарбековірусів і сортували результати в три класи: SARS-CoV-2, його найближчий сусід BANAL-236, а також інші сусіди. Керівний дизайн РНК використовує двоступеневу оптимізацію машинного навчання, набравши перший з RuleFit, а потім перепідготовку на 382 в точках даних vitro, з порогу відключення з 4 до 6.
У експериментах з синтетичних цілей РНК, обмеження аналітичного виявлення ассеї коливається від 15 до 150 femtomolar. Автори стверджують, що робота демонструє, на синтетичних цілях, можливість кеш13a засвідчити про дискримінацію між пов'язаними вірусами.
Джерело: GSM · Сполучені Штати (Англійське видання · Оригінальне китайське видання)
Фото: 图：SARS-CoV-2 病毒颗粒从实验室培养的细胞表面释出的透射电子显微镜图像。来源：NIAID-RML，Wikimedia Commons，CC BY 2.0。 / Photo: Transmission electron microscope image of SARS-CoV-2 virus particles emerging from a lab-cultured cell. Source: NIAID-RML, Wikimedia Commons, CC BY 2.0.
